Olloqui es licenciado en Filosofía por la Universidad Pontificia de Salamanca y máster en gestión de recursos humanos por la escuela de negocios de ESDEN (Madrid). Ha completado su formación con, entre otros, un Diplôme d"Études Supérieures Européennes por la Universidad de Nancy y un programa de Advanced Management por el Instituto de Empresa Business School.
Su trayectoria profesional le ha llevado también al extranjero. En concreto, ha trabajado en la embajada española de Hungría y en la Universidad de Economía de Budapest, además de ser investigador en la European University Institute de Florencia. Durante los últimos 17 años ha desarrollado su actividad profesional, siempre como director de recursos humanos, en Lignotock (empresa del sector auxiliar de la automoción), Victorio Luzuriaga (del mismo sector) y Gamesa Eólica. Posee su propia consultora de recursos humanos y es profesor asociado de la Universidad Pública de Navarra en el Departamento de Gestión de Empresas.
José Javier Olloqui entra el "think tank" para cubrir la vacante que de manera interina ocupaba el catedrático de organización de empresas Emilio Huerta, quien continuará vinculado a Institución Futuro como director del Centro para la Competitividad de Navarra (CCN). Huerta había cubierto la vacante de director de la institución después de la marcha de Julio Pomés el pasado mes de febrero.
Institución Futuro, fundada en 2001, es un centro de investigación socioeconómica que cuenta con el respaldo de medio centenar de socios, en su mayoría empresarios y profesionales de la comunidad foral. El objetivo del think tank es diseñar y promover un mejor futuro de la sociedad civil navarra mediante el análisis de las políticas públicas y la presentación de propuestas a través de investigaciones y actividades formativas.