La investigación constituye el núcleo de las actividades de Institución Futuro, de acuerdo con su condición de think tank. En coherencia con el espíritu fundacional, las investigaciones de la Institución están orientadas a contribuir al desarrollo del mejor futuro para Navarra, tanto desde el punto de vista económico como social. Esta idea se concreta en una serie de líneas de trabajo, en las que siempre están presentes los principios de sostenibilidad y competitividad.
En cuanto a la dinámica de la investigación, Institución Futuro apuesta por proyectos a largo plazo, aunque también se realizan trabajos de duración breve, adscritos a asuntos de actualidad inmediata. En los proyectos suelen colaborar investigadores externos, pero la dirección y el control siempre depende de Institución Futuro.
Las líneas de investigación que abordamos son las siguientes: